Николай Никанорович Глубоковский родился в селе Кичменгский городок Вологодской губернии в семье священника. Учился в Никольском духовном училище и Вологодской духовной семинарии. В 1884–1889 учился в Московской духовной академии. В 1889, защитив магистерскую диссертацию, преподавал в Воронежской духовной семинарии. В 1891 Н.Н. Глубоковский был приглашен в Санкт-Петербургскую духовную академию на кафедру Священного Писания Нового Завета, которую занимал более 25 лет в качестве экстраординарного профессора. В годы подготовки к Поместному собору Русской православной церкви был членом епархиальной комиссии, в другой комиссии разрабатывал новый устав духовных академий. В 1919 в новообразованном Петроградском богословском институте исполнял должность архивиста и архивариуса. После эмиграции в 1921 он читал курсы богословия в Пражском, Белградском и Софийском университетах. Н.Н. Глубоковский состоял членом-корреспондентом Российской академии наук, Болгарской академии наук, был почетным членом Библейского общества в Лондоне, почетным членом Московской, Киевской и Казанской духовных академий, Московского и Петроградского археологических институтов, действительным членом Общества истории и древностей российских при Московском университете, действительным членом Императорского православного палестинского общества, издал около 40 крупных работ и множество статей.
Основные труды: Благовестие Апостола Павла по его происхождению и существу: библейско-богословское исследование: кн.1–3. – СПб.,1905–1912; Блаженный Феодорит, епископ Киррский. Его жизнь и литературная деятельность: церковно-историческое исследование. – М., 1890; Высокопреосвященный Смарагд (Крыжановский), архиепископ Рязанский: его жизнь и деятельность. – СПб., 1914; Из лекций по Священному Писанию Нового Завета, читаных студентам С.-Петербургской духовной академии в 1896–1897 учеб. году. – СПб., 1897; О реформе Духовной школы. – СПб., 1908; О послании Апостола Павла к фессалоникийцам. – Пг., 1915; Русская богословская наука в ее историческом развитии и новейшем состоянии. – Варшава, 1928.