Семен Васильевич Завгородний родился в 1904 г.в семье крестьянина хутора Селезневский Курской области. Окончил в 1922 году Обояньскую школу садоводства. Занимался сельским хозяйством, а затем был разнорабочим в Песчанской экономии завода Коммунар. С 1925 по 1928 год учился в Курской Губсовпартшколе, а затем с 1928 по 1929 год работал преподавателем обществоведения в школе II ступени. В 1929 году С.В.Завгородний был командирован комсомолом в счет комсомольской тысячи на учебу в Воронежский Госуниверситет на химический факультет, который окончил в 1934 году. В этом же году поступил в аспирантуру НИИ химии к профессору А.Д.Богоявлескому по специальности органическая химия, окончив ее в 1936 году. После защиты диссертации в 1938 году решением совета ВГУ ему была присуждена ученая степень кандидата химических наук, и в этом же году ВАК утвердила его в звании доцента кафедры органической химии. Все последующие годы вплоть до 1960 вся педагогическая и научная деятельность С.В.Завгороднего была связана с кафедрой органической химии химфака ВГУ.

С 1937 по 1946 год С.В.Завгородний – ученый секретарь НИИ химии и ВГУ.В 1950 году он был принят в докторантуру ИОХ АН СССР сроком на два года с правом проведения химического эксперимента в университете. Его научным консультантом был академик А.В.Топчиев. После успешной защиты в 1952 году докторской диссертации на тему «Исследования в области реакций непредельных соединений в присутствии катализатора фтористого бора» был утвержден в ученом звании профессора кафедры органической химии химфака ВГУ и избран на должность заведующего кафедрой органической химии (вместо Ф.Г.Пономарева), которой заведовал до 1960 года.

В 1954 году старейший профессор химфака А.П.Палкин попросил освободить его от должности декана. На освободившуюся должность был назначен С.В.Завгородний. Он руководил факультетом до 1957 года.

Помимо большой научной работы С.В.Завгородний много внимания уделял учебному процессу. Он читал курс органической химии на химфаке и биофаке, спецкурсы «Химия углеводородов жирного ряда», «Химия углеводородов нефти», «Химия ВМС».

Многие годы С.В.Завгородний занимался общественной работой. Был секретарем комсомольской организации, партгруппором, членом партбюро, секретарем парторганизации.

Награжден медалью «За доблестный труд в годы Великой Отечественной войны 1941 – 45 гг.» и орденом Красного Знамени за выслугу лет.

В 1968 году С.В.Завгородний переехал в г.Киев, где был избран на должность зав.кафедрой химии Политехнического института.